Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcQ61315 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcQ61315 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcQ61315 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ApcQ61315 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ApcQ61315 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ApcQ61315 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ApcQ61315 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms