Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mkrn3Q60764 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mkrn3Q60764 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms