Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF38BQ5VTL8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF38BQ5VTL8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms