Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psme4Q5SSW2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psme4Q5SSW2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme4Q5SSW2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms