Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT3Q5FWE3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT3Q5FWE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT3Q5FWE3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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