Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Spsb3Q571F5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spsb3Q571F5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms