Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Carmil2Q3V3V9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Carmil2Q3V3V9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Carmil2Q3V3V9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms