Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm10Q3UTQ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm10Q3UTQ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm10Q3UTQ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm10Q3UTQ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prdm10Q3UTQ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm10Q3UTQ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.2 ms