Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl4Q3URY0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl4Q3URY0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms