Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc10Q3TLI0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc10Q3TLI0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc10Q3TLI0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms