Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd11Q1RNF8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd11Q1RNF8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms