Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.259e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.241e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.189e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ARHGEF40-204ENST00000555038 1796 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.189e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SYMPK-209ENST00000598155 1603 ntTSL 522.32■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KIF1C-204ENST00000574165 799 ntTSL 522.31■■□□□ 1.169e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.059e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-218ENST00000544696 567 ntTSL 321.1■□□□□ 0.979e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FBXO41-202ENST00000519873 580 ntTSL 420.66■□□□□ 0.99e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.899e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-213ENST00000524975 678 ntTSL 320.63■□□□□ 0.899e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.89e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-203ENST00000503114 1904 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.699e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.669e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 STARD13-209ENST00000567873 2037 ntTSL 1 (best)19.14■□□□□ 0.659e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SH3BP1-202ENST00000417536 2858 ntTSL 218.88■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-234ENST00000566634 1540 ntTSL 518.77■□□□□ 0.66e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ABCC3-204ENST00000503304 542 ntTSL 518.75■□□□□ 0.599e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 HDAC5-210ENST00000591714 667 ntTSL 318.58■□□□□ 0.569e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-214ENST00000525415 580 ntTSL 418.36■□□□□ 0.539e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-219ENST00000545245 709 ntTSL 418.29■□□□□ 0.529e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.59e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.499e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.479e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.469e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.419e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-206ENST00000514219 459 ntTSL 517.58■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SERINC2-203ENST00000487207 735 ntTSL 217.57■□□□□ 0.49e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 317.34■□□□□ 0.379e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-207ENST00000466716 640 ntTSL 516.99■□□□□ 0.319e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-208ENST00000562461 591 ntTSL 416.84■□□□□ 0.299e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TPT1-AS1-220ENST00000524062 2285 ntTSL 216.75■□□□□ 0.271e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.279e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 COL6A1-206ENST00000498614 2358 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.269e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.269e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.269e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-212ENST00000532632 505 ntTSL 316.49■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-208ENST00000529332 2107 ntTSL 516.46■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-207ENST00000515223 5707 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.189e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 GIT1-213ENST00000583413 546 ntTSL 416.12■□□□□ 0.179e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 216.05■□□□□ 0.169e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RIN3-206ENST00000555589 2814 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.159e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 315.92■□□□□ 0.149e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 215.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.099e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RBCK1-208ENST00000414880 765 ntTSL 315.58■□□□□ 0.089e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 NKD1-203ENST00000566396 748 ntTSL 315.52■□□□□ 0.089e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.059e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.059e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-215ENST00000526301 2354 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.049e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.039e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.16■□□□□ 0.029e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-207ENST00000562228 734 ntTSL 314.96□□□□□ -0.019e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 414.92□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.029e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.039e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 514.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.069e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-220ENST00000564785 4820 ntTSL 514.63□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.089e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-220ENST00000545405 582 ntTSL 214.46□□□□□ -0.099e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-211ENST00000531406 1089 ntTSL 214.27□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-212ENST00000563441 2664 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.146e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 FADS1-214ENST00000540767 742 ntTSL 314.1□□□□□ -0.159e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TRIM41-204ENST00000508930 3834 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SYMPK-210ENST00000598329 1000 ntTSL 313.97□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.176e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SERPINH1-208ENST00000526638 719 ntTSL 213.89□□□□□ -0.191e-10■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 PGD-209ENST00000496718 506 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 KMT2C-207ENST00000452749 479 ntTSL 513.76□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.229e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.239e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RIN3-202ENST00000418924 3592 ntTSL 213.55□□□□□ -0.249e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.39e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SH3BP1-206ENST00000469947 2612 ntTSL 213.15□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.319e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.339e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 TM9SF1-207ENST00000528895 961 ntTSL 212.93□□□□□ -0.349e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 RIN3-204ENST00000553992 577 ntTSL 412.72□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.399e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 ABCC3-203ENST00000502426 5326 ntTSL 212.61□□□□□ -0.399e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.396e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.49e-6■■■■■ 29.7
PCBP1Q15365 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.419e-6■■■■■ 29.7
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