Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTCH1Q13635 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTCH1Q13635 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
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