Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL4AQ13619 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL4AQ13619 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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