Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Siah2Q06986 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah2Q06986 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 959.7 ms