Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Caprin2Q05A80 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Caprin2Q05A80 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms