Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr16c6Q05A13 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sdr16c6Q05A13 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms