Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APBA1Q02410 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA1Q02410 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms