Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2C1P98194 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms