Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmklr1P97468 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cmklr1P97468 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms