Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl31P62900 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl31P62900 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms