Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERV-K104P61576 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERV-K104P61576 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms