Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP107P57740 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP107P57740 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP107P57740 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP107P57740 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP107P57740 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP107P57740 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP107P57740 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP107P57740 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP107P57740 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP107P57740 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP107P57740 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP107P57740 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP107P57740 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP107P57740 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP107P57740 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP107P57740 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP107P57740 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP107P57740 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP107P57740 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP107P57740 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP107P57740 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP107P57740 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms