Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Samsn1P57725 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Samsn1P57725 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Samsn1P57725 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms