Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NrlP54846 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NrlP54846 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NrlP54846 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NrlP54846 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NrlP54846 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NrlP54846 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NrlP54846 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NrlP54846 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NrlP54846 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NrlP54846 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NrlP54846 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NrlP54846 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NrlP54846 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NrlP54846 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NrlP54846 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NrlP54846 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NrlP54846 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NrlP54846 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NrlP54846 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NrlP54846 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NrlP54846 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NrlP54846 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NrlP54846 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NrlP54846 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NrlP54846 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NrlP54846 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NrlP54846 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NrlP54846 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NrlP54846 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NrlP54846 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms