Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Psen1P49769 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psen1P49769 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms