Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf1P46099 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf1P46099 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf1P46099 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf1P46099 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms