Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmx3P42581 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms