Protein–RNA interactions for Protein: P41139

Id4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Id4P41139 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Id4P41139 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Id4P41139 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Id4P41139 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Id4P41139 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Id4P41139 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Id4P41139 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Id4P41139 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Id4P41139 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Id4P41139 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Id4P41139 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Id4P41139 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Id4P41139 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Id4P41139 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms