Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TfamP40630 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TfamP40630 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TfamP40630 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TfamP40630 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TfamP40630 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TfamP40630 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TfamP40630 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TfamP40630 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TfamP40630 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TfamP40630 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TfamP40630 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TfamP40630 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TfamP40630 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TfamP40630 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TfamP40630 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TfamP40630 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms