Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A3P38919 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms