Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGM1P36871 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGM1P36871 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGM1P36871 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGM1P36871 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGM1P36871 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGM1P36871 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGM1P36871 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM1P36871 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM1P36871 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM1P36871 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM1P36871 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM1P36871 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM1P36871 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGM1P36871 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM1P36871 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGM1P36871 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGM1P36871 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM1P36871 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM1P36871 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM1P36871 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGM1P36871 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms