Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa10P31310 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms