Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tacr1P30548 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms