Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccnd2P30280 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccnd2P30280 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms