Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFNA1P20827 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms