Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NelfeP19426 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NelfeP19426 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NelfeP19426 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NelfeP19426 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NelfeP19426 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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