Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIM1P11309 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIM1P11309 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIM1P11309 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIM1P11309 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIM1P11309 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIM1P11309 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIM1P11309 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIM1P11309 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIM1P11309 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIM1P11309 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIM1P11309 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms