Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FlgP11088 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FlgP11088 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FlgP11088 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FlgP11088 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FlgP11088 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FlgP11088 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FlgP11088 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FlgP11088 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FlgP11088 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FlgP11088 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FlgP11088 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FlgP11088 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FlgP11088 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FlgP11088 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FlgP11088 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FlgP11088 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FlgP11088 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FlgP11088 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FlgP11088 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FlgP11088 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FlgP11088 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FlgP11088 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FlgP11088 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FlgP11088 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FlgP11088 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FlgP11088 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FlgP11088 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FlgP11088 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FlgP11088 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FlgP11088 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FlgP11088 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FlgP11088 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FlgP11088 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FlgP11088 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FlgP11088 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FlgP11088 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FlgP11088 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FlgP11088 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FlgP11088 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FlgP11088 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FlgP11088 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FlgP11088 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FlgP11088 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FlgP11088 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms