Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb5P09079 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb5P09079 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms