Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc1P02468 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lamc1P02468 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lamc1P02468 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms