Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01647 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01647 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01647 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01647 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01647 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
P01647 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01647 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01647 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
P01647 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P01647 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P01647 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P01647 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P01647 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01647 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01647 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01647 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01647 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01647 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01647 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01647 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01647 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01647 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01647 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
P01647 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01647 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01647 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
P01647 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01647 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01647 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01647 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01647 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01647 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01647 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01647 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01647 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01647 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01647 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01647 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01647 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01647 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01647 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
P01647 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01647 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01647 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01647 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
P01647 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01647 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01647 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01647 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01647 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01647 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01647 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms