Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLIN3O60664 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms