Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap6O54834 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arhgap6O54834 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms