Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpd52l1O54818 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpd52l1O54818 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms