Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabep1O35551 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabep1O35551 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms