Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf5O35445 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf5O35445 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.6 ms