Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac1O09106 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac1O09106 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac1O09106 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms