Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CckarO08786 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CckarO08786 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CckarO08786 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CckarO08786 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CckarO08786 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CckarO08786 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CckarO08786 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CckarO08786 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CckarO08786 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CckarO08786 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms