Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna3O08545 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efna3O08545 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efna3O08545 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.2 ms